浦东新区绩效预算改革的主要措施包括以下四个方面：
一是建立制度，做好组织保障。近年来，先后制定出台了《浦东新区财政绩效预算管理办法（试行）》、《浦东新区财政预算监督办法（试行）》、《浦东新区街道预算民主理财管理办法（试行）》、《浦东新区政府投资项目绩效评价办法（试行）》等各类办法、规程13个，为浦东新区绩效预算改革的顺利推行提供了有力的制度保障。在组织架构上，建立了以“绩效预算改革联席会议”为主导，财政部门统一管理，各预算部门（单位）、开发区管委会、街镇分级分层实施的组织管理体系。2007年成立了“浦东新区绩效评价中心”，专门负责评价项目的组织、实施、推进工作。
二是建立绩效评价模式基本框架。近年来，通过探索和实践，在评价观念传播、评价理论积累、评价方法积淀、评价指标和标准研制、评价组织程序等方面都积累了一定的经验，并基本形成了以“联席会议领导协调，财政部门牵头，绩效评价中心、各部门单位分级分层组织实施，引入第三方评价”为特色的绩效评价模式。同时，联合上海财经大学和复旦大学专家的力量，从浦东实际出发，对近年浦东绩效评价实践情况进行了系统梳理，组织编撰了《浦东新区财政支出绩效评价知识与实务》、《浦东新区财政支出绩效评价指标体系研究》等书籍，为浦东新区下一步绩效预算改革的深化起到了积极的推动作用，也为全国及全市绩效预算改革提供了经验。
三是拓展绩效评价的规模与内涵。近年来，以项目绩效评价为突破口，稳步推进绩效预算改革。绩效评价对象选择范围已从区本级层面延伸到原功能区域、街镇层面，评价内容涉及教育、医疗卫生、社会保障、科技发展、文化体育、公共安全、环境保护和经贸农业等；评价类型已由对项目的评价扩大到对部门（单位）评价的探索；目前完成评价项目100多个，涉及财政资金300多亿元。
四是开展对预算全过程实施绩效管理的探索研究。在大力推进项目绩效评价的同时，近年来，浦东新区结合预算编制工作，探索“目标-任务-预算-评价”环环相扣的绩效预算管理模式，将绩效预算的理念逐步贯穿于预算管理全过程。